南京市内有9个主要的汽车客运站，它们分别是：
1. 南京长途汽车总站（中央门汽车站）
2. 南京长途汽车东站
3. 南京汽车客运南站
4. 南京长途客运北站（桥北客运站）
5. 南京葛塘汽车站
6. 南京江宁汽车客运站
7. 溧水客运站
8. 高淳客运站
9. 高淳双牌石汽车客运站
此外，还有如南京汽车客运北站等其他较小的客运站。需要注意的是，一些旧的客运站如汉中门汽车站、中华门汽车站、马群客运站、下关汽车站已经不再使用。
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